Universitas Widya Kartika di pimpin oleh Rektor dan dibantu dengan dua orang wakilnya dengan konsep "Threeman Ship".

Rektor

Dr. Ir. Gembong Baskoro, M.Sc.

Wakil Rektor 1 Bidang Akademis

Drs. Darmanto A, M.Sc.

Wakil Rektor 2 Bidang Non Akademis

Dra. Felicia O. Dien Koeswantoro